Сильно охраняемая и высокотехнологичная секция Чёрной мезы. «Биодом» содержит различные лаборатории и тестовые камеры для исследования форм жизни Зена. Находящийся под землей и запечатанный тяжелыми стальными дверьми, «Биодом» также является искусственной средой обитания для пришельцев. После каскадного резонанса большинство пришельцев вырвалось на свободу.